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alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate (M2MDB005129)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2015-06-05 11:08:47 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2015-08-05 16:22:05 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers |
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| Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: | alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | An organophosphate oxoanion obtained by deprotonation of the phosphate and phosphonate OH groups of α-D-ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate; major species at pH 7.3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms: |
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| Chemical Formula: | C6H14O10P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Weight: | Average: 308.116 Monoisotopic: 308.006220647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key: | RITBIFGLPRFTSB-KVTDHHQDSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI: | InChI=1S/C6H14O10P2/c1-17(9,10)16-6-5(8)4(7)3(15-6)2-14-18(11,12)13/h3-8H,2H2,1H3,(H,9,10)(H2,11,12,13)/t3-,4-,5-,6-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS number: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name: | {[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-{[hydroxy(methyl)phosphoryl]oxy}oxolan-2-yl]methoxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional IUPAC Name: | [(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-{[hydroxy(methyl)phosphoryl]oxy}oxolan-2-yl]methoxyphosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES: | CP(O)(=O)O[C@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | belongs to the class of organic compounds known as pentose phosphates. These are carbohydrate derivatives containing a pentose substituted by one or more phosphate groups. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Pentose phosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Charge: | -3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Properties: |
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| Predicted Properties |
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| Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactions: | alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-triphosphate + Water <> alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate + Pyrophosphate alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate <> alpha-D-Ribose 1,2-cyclic phosphate 5-phosphate + Methane alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-triphosphate + Water > Hydrogen ion + Pyrophosphate + alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate > Methane + alpha-D-Ribose 1,2-cyclic phosphate 5-phosphate alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-triphosphate + Water <> alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate + Pyrophosphate alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate <> alpha-D-Ribose 1,2-cyclic phosphate 5-phosphate + Methane alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-triphosphate + Water <> alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate + Pyrophosphate alpha-D-Ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate <> alpha-D-Ribose 1,2-cyclic phosphate 5-phosphate + Methane | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMPDB Pathways: |
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| KEGG Pathways: |
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| EcoCyc Pathways: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links: |
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Enzymes
- General function:
- organic phosphonate catabolic process
- Specific function:
- Catalyzes the hydrolysis of alpha-D-ribose 1-methylphosphonate triphosphate (RPnTP) to form alpha-D-ribose 1-methylphosphonate phosphate (PRPn) and diphosphate.
- Gene Name:
- phnM
- Uniprot ID:
- P16689
- Molecular weight:
- 42010
Reactions
| Alpha-D-ribose 1-methylphosphonate 5-triphosphate + H(2)O = alpha-D-ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate + diphosphate |
- General function:
- organic phosphonate catabolic process
- Specific function:
- Catalyzes the breakage of the C-P bond in alpha-D-ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate (PRPn) forming alpha-D-ribose 1,2-cyclic phosphate 5-phosphate (PRcP).
- Gene Name:
- phnJ
- Uniprot ID:
- P16688
- Molecular weight:
- 31844
Reactions
| Alpha-D-ribose 1-methylphosphonate 5-phosphate = alpha-D-ribose 1,2-cyclic phosphate 5-phosphate + methane |