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Methanol (M2MDB000425)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2012-05-31 13:54:48 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2015-09-13 12:56:11 -0600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers |
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| Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: | Methanol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Methanol is the simplest alcohol, and is a light, volatile, colourless, flammable, poisonous liquid with a distinctive odor that is somewhat milder and sweeter than ethanol. It is produced naturally in the anaerobic metabolism of many varieties of bacteria, and is ubiquitous in the environment. As a result, there is a small fraction of methanol vapor in the atmosphere. (Wikipedia). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms: |
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| Chemical Formula: | CH4O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Weight: | Average: 32.0419 Monoisotopic: 32.02621475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key: | OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI: | InChI=1S/CH4O/c1-2/h2H,1H3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS number: | 67-56-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name: | methanol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional IUPAC Name: | methanol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES: | CO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | belongs to the class of organic compounds known as primary alcohols. Primary alcohols are compounds comprising the primary alcohol functional group, with the general structure RCOH (R=alkyl, aryl). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Alcohols and polyols | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Primary alcohols | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State: | Liquid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Charge: | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Melting point: | -97.6 °C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Properties: |
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| Predicted Properties |
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| Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactions: | Water + Pimeloyl-[acyl-carrier protein] methyl ester > Methanol + Pimeloyl-[acyl-carrier protein] Methanol + Hydrogen peroxide <> Formaldehyde +2 Water L-Lyxose + Water <> Methanol + Pectic acid Ecgonine methyl ester + Water <> Ecgonine + Methanol Pimelyl-[acyl-carrier protein] methyl ester + Water + Pimeloyl-[acyl-carrier protein] methyl ester <> Pimelyl-[acyl-carrier protein] + Methanol + Pimeloyl-[acyl-carrier protein] Pimelyl-[acyl-carrier protein] methyl ester + Water > pimelyl-[acyl-carrier protein] + Methanol Protein L-glutamate O(5)-methyl ester + Water > protein L-glutamate + Methanol Pectin + Water <> Methanol + Pectic acid Protein glutamate methyl ester + Water <> Protein glutamate + Methanol a pimeloyl-[acp] methyl ester + Water > Methanol + a pimeloyl-[acp] Protein glutamate methyl ester + Water <> Protein glutamate + Methanol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMPDB Pathways: |
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| KEGG Pathways: |
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| EcoCyc Pathways: |
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| Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References: |
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| Synthesis Reference: | Cummings, Donald Ray. Process for production of methanol from a methane gas stream. PCT Int. Appl. (2007), 21pp. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Material Safety Data Sheet (MSDS) | Download (PDF) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links: |
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Enzymes
- General function:
- Involved in two-component response regulator activity
- Specific function:
- Involved in the modulation of the chemotaxis system; catalyzes the demethylation of specific methylglutamate residues introduced into the chemoreceptors (methyl-accepting chemotaxis proteins) by CheR
- Gene Name:
- cheB
- Uniprot ID:
- P07330
- Molecular weight:
- 37467
Reactions
| Protein L-glutamate O(5)-methyl ester + H(2)O = protein L-glutamate + methanol. |
- General function:
- Involved in biotin biosynthetic process
- Specific function:
- Shows carboxylesterase activity with a preference for short chain fatty acid esters (acyl chain length of up to 6 carbons). Also displays a weak thioesterase activity. Can form a complex with CoA, and may be involved in the condensation of CoA and pimelic acid into pimeloyl-CoA, a precursor in biotin biosynthesis
- Gene Name:
- bioH
- Uniprot ID:
- P13001
- Molecular weight:
- 28505
Reactions
| Pimelyl-[acyl-carrier protein] methyl ester + H(2)O = pimelyl-[acyl-carrier protein] + methanol. |
- General function:
- Involved in catalase activity
- Specific function:
- Bifunctional enzyme with both catalase and broad- spectrum peroxidase activity. Displays also NADH oxidase, INH lyase and isonicotinoyl-NAD synthase activity
- Gene Name:
- katG
- Uniprot ID:
- P13029
- Molecular weight:
- 80023
Reactions
| Donor + H(2)O(2) = oxidized donor + 2 H(2)O. |
| 2 H(2)O(2) = O(2) + 2 H(2)O. |
- General function:
- Involved in catalase activity
- Specific function:
- Decomposes hydrogen peroxide into water and oxygen; serves to protect cells from the toxic effects of hydrogen peroxide
- Gene Name:
- katE
- Uniprot ID:
- P21179
- Molecular weight:
- 84162
Reactions
| 2 H(2)O(2) = O(2) + 2 H(2)O. |
- General function:
- Involved in pectinesterase activity
- Specific function:
- Putative thioesterase. Does not bind pectin, and has no pectinesterase activity
- Gene Name:
- ybhC
- Uniprot ID:
- P46130
- Molecular weight:
- 46082
- General function:
- Not Available
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- aes
- Uniprot ID:
- P23872
- Molecular weight:
- Not Available
Transporters
- General function:
- Involved in transporter activity
- Specific function:
- Non-specific porin
- Gene Name:
- ompN
- Uniprot ID:
- P77747
- Molecular weight:
- 41220
- General function:
- Involved in transporter activity
- Specific function:
- Uptake of inorganic phosphate, phosphorylated compounds, and some other negatively charged solutes
- Gene Name:
- phoE
- Uniprot ID:
- P02932
- Molecular weight:
- 38922
- General function:
- Involved in transporter activity
- Specific function:
- OmpF is a porin that forms passive diffusion pores which allow small molecular weight hydrophilic materials across the outer membrane. It is also a receptor for the bacteriophage T2
- Gene Name:
- ompF
- Uniprot ID:
- P02931
- Molecular weight:
- 39333
- General function:
- Involved in transporter activity
- Specific function:
- Forms passive diffusion pores which allow small molecular weight hydrophilic materials across the outer membrane
- Gene Name:
- ompC
- Uniprot ID:
- P06996
- Molecular weight:
- 40368